В конфессиональном отношении государство характеризовалось присутствием трех религий — христианства, иудаизма и ислама, причем первая была представлена двумя конфессиями: православием и католичеством. После образования ВКЛ в стране предпринимались неоднократные попытки крещения в католичество языческих балтских племен и распространения влияния католической церкви на территории, где проживало православное славянское население. Такая ситуация в ВКЛ сохранялась до конца XIV в. Язычники Литвы и Жемайтии слабо влияли на внутреннюю политику государства. А первые великие князья литовские опекали православную церковь. Они понимали, что поддержка православной церкви поможет им объединить вокруг Вильны восточнославянские земли. С другой стороны, первые князья ВКЛ использовали религию в политических целях.

Сохранилась информация, что князь Миндовг в начале своего правления принял «веру христианскую с Востока со многими своими боярами», т. е. перешел из язычества в православие. Но эта версия не нашла точного подтверждения, поэтому не все ученые ее признают. В 1253 г. Миндовг принял католичество. Скорее всего, переход князя в православную веру, затем в католичество мог быть политическим решением с целью сохранения власти.

А вот его сын Войшелк, будучи язычником, жестоко обращался со своими подданными, но затем, приняв православную веру, резко изменился — ​оставил княжеский престол и постригся в монахи. Три года он жил в Полонском монастыре (Украина), а потом основал монастырь близ Новогородка (Лавришевский монастырь). Его вера, как свидетельствуют летописи, представляла собой порыв души. Он поставил задачу окрестить языческую Литву по православному обряду и даже в 1265 г. пригласил священников из Пскова. Но этот замысел не был осуществлен, так как там княжил Довмонт — ​убийца его отца.

Великие князья литовские пытались или создать отдельную от Киева мит­рополию, или назначить киевским митрополитом своего ставленника. Со времен княжения великого князя Гедимина начались попытки создания отдельной православной митрополии с центром в Новогородке. С согласия константинопольского патриарха Иоанна ХIII Глики была организована Литовско-Новогородская митрополия. В ее состав вошли территории Полоцкой и Туровской епархий. Вообще до Кревской унии 1385 г. православие было в ВКЛ господствующей конфессией.

Православная церковь играла значительную роль в общественной жизни ВКЛ. Например, полоцкие архиепископы входили в совет полоцкого князя, присутствовали на съездах местной шляхты, подписывали договоры с другими княжествами и городами. Церковь рассматривала традиционные дела, связанные с нарушением церковных основ в семейно-бытовой жизни, — ​браки не по «закону», их расторжение, разврат, богохульство.

Существуют летописные сведения о том, что великий князь Ольгерд перешел в православную веру в браке с витебской княжной Марией, а дети от брака с Марией в зрелом возрасте приняли православие. Правда, похоронили князя
по языческому обряду.