Первый номер журнала "Прикладная биохимия и микробиология" вышел в январе 1965 г., его главным редактором тогда был назначен член-корреспондент АН СССР В.Н. Букин.

Это было время, когда прикладная биологическая наука завоевывала новые горизонты, когда, по существу, рождалось то, что впоследствии назвали биотехнологией. В СССР к тому времени была создана мощная пищевая промышленность, основанная на биохимических процессах, промышленность антибиотиков, зарождалась микробиологическая промышленность. Работали многочисленные отраслевые институты, был организован Центр биологических исследований в подмосковном Пущине, почти все академии наук союзных республик имели в своем составе институты биохимического и микробиологического профиля.

Организация журнала была возложена на издательство "Наука" и Институт биохимии им. А.Н. Баха АН СССР, наиболее авторитетное научное учреждение в СССР в области технической биохимии. В состав редколлегии и редакционного совета вошли ведущие в этой области ученые - академики А.И. Опарин, В.Н. Шапошников, Н.Д. Иерусалимский, А.А. Имшенецкий, член-корреспондент АН СССР В.Л. Кретович, академики союзных республик С.В. Дурмишидзе, Е.Н. Квасников. Позже их ряды пополнили академики И.И. Гительзон, М.В. Иванов, М.П. Кирпичников, члены-корреспонденты РАН А.А. Воронин и И.С. Кулаев, а также ученые, представляющие страны СНГ: Э.Г. Африкян, Т.Д. Дарканбаев, А.Н. Иляетдинов, Г.И. Квеситадзе, А.Г. Лобанок, В.В. Смирнов.

После смерти В.Н. Букина в 1979 г. журнал возглавил член-корреспондент АН СССР В.Л. Кретович, а после его кончины в 1993 г. - член-корреспондент РАН Б.Ф. Поглазов.

Начиная с первого номера, журнал выходит в русской и английской версиях. Первым издателем английской версии было издательство "The Faraday Press, Inc.", затем "Plenum Publishing Corporation", а с 1995 г. МАИК "Наука/Интерпериодика". Учредители журнала - РАН, Отделение физико-химической биологии и Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН. Журнал имеет широкий авторский коллектив, в который входят, в основном, ученые из стран СНГ: России, Украины, Беларуси, Грузии, Армении, Азербайджана, Казахстана и Узбекистана.

В первые годы существования в журнале были опубликованы многочисленные работы по различным проблемам пищевой промышленности и вопросам питания, в числе которых были обзорные статьи академика А.И. Опарина и академика АМН СССР А.А. Покровского. Наиболее полно были представлены исследования в молочной и мясной промышленности, производстве витаминов, чая, коньяка. Широко освещались пивоварение, спиртовая промышленность, виноделие, лимоннокислое брожение. Большое место было отведено статьям по биохимии зерна, его хранению и переработке, в частности, хлебопечению.

Развитие микробиологической промышленности привело к значительному числу публикаций по получению кормовых белковых препаратов, основу которых составляли дрожжи, выращенные на определенных фракциях углеводородов нефти (Н.Д. Иерусалимский, Г.К. Скрябин, С.В. Чепиго). Публикации затрагивали практически все этапы технологического процесса выработки кормового препарата - аминокислоты лизина (В.Н. Бунин, М.Е. Бекер). Впоследствии на страницах журнала появились сообщения о биосинтезе других аминокислот - глутаминовой кислоты, треонина, триптофана и т.д. (Е.Л. Рубан). С публикаций в журнале начинали многие известные авторы-биологи, впоследствии выпустившие свои собственные книги. Кстати, найти книгу (любую!) по биотехнологии сегодня не проблема: по указанной ссылке располагается мощный поиск "Книгоед", который содержит интерактивную базу всех продающихся книг в 50 ведущих интернет магазинах.

Наряду с работами по теоретическим основам биосинтеза различных природных соединений публиковались материалы чисто прикладного характера. За время существования журнала вышла серия классических работ по витаминам (В.Н. Букин, В.Я. Быховский, А.А. Дмитровский и др.). Они касались в первую очередь механизмов биогенеза витаминов А и B12 и его кормовых препаратов на основе метанового брожения.

Видное место среди вышедших у нас статей занимают публикации о ферментах микроорганизмов - рассматривалось все, от поиска продуцентов, их получения, изучения физико-химических и каталитических свойств, первичной структуры, до регуляции синтеза, кинетики и механизма действия. Значительное место было отведено статьям по применению ферментов в различных областях промышленности, сельского хозяйства и медицины. Среди наиболее значительных из них - серии материалов по протеиназам (Е.Д. Каверзнева) и их ингибиторам (В.В. Мосолов), целлюлолитическим ферментам (Р.В. Фениксова), рибонуклеазам (С.И. Безбородова), литическим ферментам (С.А. Коновалов), липоксигеназе (Е.В. Будницкая), а также по ферментам, деградирующим стенки высших растений, хитиназе, ксиланазе липазе, монооксигеназам, бромпероксидазе, а- и в-галактозидазам, а-амилазе, глюкозоизомеразе.

В последние годы на страницах журнала появилось много статей по иммобилизованным ферментам и микробным клеткам, как в плане поиска носителей, так и практического использования систем для получения продуктов ферментативного катализа.

Видное место занимают у нас публикации по получению, выделению и изучению вторичных продуктов микробного метаболизма - антибиотикам, алкалоидам, средствам защиты растений. На протяжении всего времени существования журнал освещает работы по биохимическим основам иммунитета растений, многие из которых ныне признаны классическими (Л.В. Метлицкий), а также по биохимическим аспектам гормональной регуляции покоя и иммунитета растений. В плане прикладных вопросов по близкой к вышеизложенному тематике находятся исследования по биохимии созревания сочных плодов и хранения картофеля, плодов, овощей. В области биохимии высших растений наиболее значимые публикации преимущественно касались стероидных гликозидов и изопреноидов, алкалоидов и галактоманнанов.

Широко используется на страницах журнала проблема защиты окружающей среды. Можно перечислить лишь основные направления. Одно из них - микробиологическая (ферментативная) деградация ксенобиотиков как теоретическая проблема, где рассматриваются биохимические пути их деструкции. В плане практического приложения - микробиологические методы удаления газовоздушных выбросов техногенного происхождения, деградация отравляющих веществ, нефтяных "пятен" на почве и в воде. Работы в большинстве своем носят приоритетный характер. Уникальными являются публикации о превращениях токсических органических соединений высшими растениями, в результате имеющего место контакта через воздух. Очистка сточных вод промышленных предприятий также в сфере внимания авторов. В последние годы появилось несколько материалов, рассматривающих потенциальную возможность замены реакций органического синтеза ферментативным катализом с целью получения полупродуктов для синтеза полимеров, замены химических технологий, где образуются токсические соединения или отходы, биологическими процессами. Например, ферментативное получение фенола из бензола.

Начиная с первых номеров, журнал публикует работы по выделению и очистке микробных метаболитов и продуктов обмена веществ высших растений (Г.В. Самсонов). Здесь можно найти описание и практическую реализацию всех современных физико-химических методов получения ферментов, аминокислот, антибиотиков и многих других природных соединений. Из работ последних лет выделяются исследования по использованию иммуноферментного метода анализа различных природных соединений.

Отдельные номера журнала целиком посвящаются юбилеям ведущих научных организаций (Института биохимии им. А.Н. Баха РАН, Института биохимии и физиологии микроорганизмов РАН, Государственного научного центра прикладной микробиологии и т.д.). В журнале представлена информация о проходивших в России научных конференциях и семинарах, рецензии на книги российских и зарубежных издательств. На страницах журнала принято отмечать юбилейные даты
ведущих ученых, работающих в области биохимии, микробиологии и биотехнологии. А теперь и он сам празднует свое 35-летие.